РЕЗЮМЕ
По последним данным научных исследований было установлено, что микробиота кишечника (МК) образует обширную сеть, соединяющую кишечник, нервную систему, легкие, кожу, полость рта, мочевыводящие и репродуктивные пути. Взаимосвязь между этими экосистемами играет немаловажную роль в формировании крепкого здоровья и борьбе с различными заболеваниями. Целью нашего исследования является определение значения МК и изучение роли дисбактериоза в развитии некоторых хронических (аллергических, воспалительных), метаболических (диабет), аутоиммунных (тиреоидит Хашимото и др.) и нервно-психических заболеваний (болезнь Альцгеймера, Паркинсона, аутизм и др.) заболеваний. Поскольку эти заболевания связаны с отдельными микроорганизмами, их можно лечить, воздействуя на микробиоту. В то же время показано, что молекулярно-генетические методы (секвенирование нового поколения, метод дробовика и др.) являются наиболее подходящими для изучения состава микробиома.
Keywords: кишечный микробиом, дисбиоз, хронические заболевания, секвенирование нового поколения, метод дробовика

---

ЛИТЕРАТУРА

1. Singh R.K., Chang H.W., Yan D., Lee K.M., et al. Influence of diet on the gut microbiome and implications for human health // J. Transl. Med., 2017; 15:73. doi: 10.1186/s12967-017-1175-y.
2. Gentile C.L., Weir T.L. The gut microbiota at the intersection of diet and human health // Science. 2018; 362:776-780.
3. Rajilic-Stojanovic M., Jonkers D.M., Salonen A., Hanevik K., et al. Intestinal microbiota and diet in IBS: Causes, consequences, or epiphenomena? // Am. J. Gastroenterol. 2015;110:278-287
4. Perry R.J., Peng L., Barry N.A., Cline G.W., et al. Acetate mediates a microbiome-brain-beta-cell axis to promote metabolic syndrome // Nature. 2016; 534:213-217.
5. Andoh A. Physiological role of gut microbiota for maintaining human health // Digestion. 2016;93:176-181.
6. Jandhyala S.M., Talukdar R., Subramanyam C., Vuyyuru H., et al. Role of the normal gut microbiota // World J. Gastroenterol. 2015; 21:8787-8803.
7. Vangay P., Johnson A.J., Ward T.L., Al-Ghalith G.A., et al. US immigration westernizes the human gut microbiome // Cell. 2018;175:962-972.
8. Litvak Y., Byndloss M.X., Baumler A.J. Colonocyte metabolism shapes the gut microbiota // Science. 2018;362:eaat 9076. doi: 10.1126/science.aat 9076.
9. Byndloss M.X., Olsan E.E., Rivera-Chavez F., Tiffany C.R., et al. Microbiota-activated PPAR-gamma signaling inhibits dysbiotic Enterobacteriaceae expansion // Science. 2017;357:570-575.
10. Kim S., Kim J.H., Park B.O., Kwak Y.S. Perspectives on the therapeutic potential of short-chain fatty acid receptors // BMB Rep. 2014;47:173-178.
11. Morrison D.J., Preston T. Formation of short chain fatty acids by the gut microbiota and their impact on human metabolism // Gut Microbes. 2016; 7:189-200.
12. Versalovic J., Dore J., Guarner F., Luna RA., Ringel Y. Microbiome-Based Diagnostics: Ready for Applications in Laboratory Medicine? // Clinical Chemistry, Volume 63, Issue 11, 1 November 2017, Pages 1674-1679.
13. Faust K, Lahti L, Gonze D, et al. Metagenomics meets time series analysis: unraveling microbial community dynamics // Curr Opin Microbiol 2015;25:56-66
14. Sciarra F., Franceschini E., Campolo F., Venneri M.A. The Diagnostic Potential of the Human Blood Microbiome: Are We Dreaming or Awake? // Int. J. Mol. Sci. 2023, 24(13), 10422. doi: 10.3390/ijms241310422
15. Wensel CR, Pluznick JL, Salzberg SL, Sears CL. Next-generation sequencing: insights to advance clinical investigations of the microbiome // J Clin Invest. 2022 Apr 1;132(7):e154944. doi: 10.1172/JCI154944.
16. Simner PJ, Miller S, Carroll KC. Understanding the Promises and Hurdles of Metagenomic Next-Generation Sequencing as a Diagnostic Tool for Infectious Diseases // Clin Infect Dis. 2018 Feb 10;66(5):778-788. doi: 10.1093/cid/cix881.
17. Yu S, Xiong Y, Fu Y, Chen G, et al. Shotgun metagenomics reveals significant gut microbiome features in different grades of acute pancreatitis // Microb Pathog. 2021 May;154:104849. doi: 10.1016/j.micpath.2021.104849
18. Jovel J, Patterson J, Wang W, Hotte N, et al. Characterization of the Gut Microbiome Using 16S or Shotgun Metagenomics // Front Microbiol. 2016 Apr 20;7:459. doi: 10.3389/fmicb.2016.00459.
19. Costea PI, Hildebrand F, Arumugam M, Backhed F, et al. Enterotypes in the landscape of gut microbial community composition // Nat Microbiol. 2018;3:8-16.
20. Lai S, Yan Y, Pu Y, Lin S, et al. Enterotypes of the human gut mycobiome // Microbiome. 2023 Aug 11;11(1):179. doi: 10.1186/s40168-023-01586-y
21. Lazaridis N., Germanidis G. Current insights into the innate immune system dysfunction in irritable bowel syndrome // Ann. Gastroenterol. 2018; 31: 171-187. doi: 10.20524/aog.2018.0229.
22. Si X., Shang W., Zhou Z., Strappe P., et al. Gut microbiome-induced shift of acetate to butyrate positively manages dysbiosis in high fat diet // Mol. Nutr. Food Res. 2018;62:1700670.
23. Dinan TG, Cryan JF. Gut Instincts: Microbiota as a Key Regulator of Brain Development, Ageing and Neurodegeneration: Microbiota-Gut-Brain Axis Across the Lifespan // J Physiol, 2017. 595(2):489-503.
24. Allegretti, J.R., Fischer, M., Sagi, S.V., Bohm, M.E., et al. (2019). Fecal microbiota transplantation capsules with targeted colonic versus gastric delivery in recurrent Clostridium difficile infection: a comparative cohort analysis of high and lose dose // Dig. Dis. Sci. 64, 1672-1678.
25. Chen J., Zaman A., Ramakrishna B., Olesen S.W. Stool banking for fecal microbiota transplantation: methods and operations at a large stool bank // MedRxiv [Preprint]. 2020. doi: 10.1101/2020.09.03.20187583
26. Mu Q., Kirby J., Reilly C.M., Luo X.M. Leaky gut as a danger signal for autoimmune diseases // Front. Immunol.2017;8:598.
27. Brennan C.A., Garrett W.S. Gut microbiota, inflammation, and colorectal cancer // Annu. Rev. Microbiol. 2016;70:395-411.